Koszty ETS coraz mocniej obciążają ceny energii w Polsce. W przypadku prądu sprzedawanego przemysłowi ich udział może sięgać choćby 50 proc., podczas gdy średnia dla Unii Europejskiej wynosi około 11 proc. Polskie firmy energetyczne domagają się zmian w systemie, wskazując, iż obecne zasady szczególnie mocno uderzają w państwa wciąż w dużym stopniu zależne od paliw kopalnych.